《菲律賓星報》26日引述菲海岸警隊發言人巴里羅的話說，菲媒所謂“菲國家調查局初步調查認為海警人員掃射臺漁船可能涉嫌過度使用武力、違反交火原則”的報道“尚屬臆測”，“現在認定海警人員執法上有疏失，尚為時過早，因為正式調查報告還未完成”。與此同時，越來越多的菲政界人士加入聲討阿基諾三世的行列，呼吁政府快速回應臺灣方面提出的司法協助要求，妥善解決漁民被射殺問題。有議員質疑：“臺灣方面已經展現出聯合調查的調停姿態，我們沒有理由不同意。除非我們在掩飾什么?！?/p>

　　《菲律賓星報》25日引述接近該調查消息人士的話稱，菲方對海警射殺臺灣“廣大興28號”漁民案的初步調查發現，涉案海警人員有過度使用武力、違反交火規則之嫌。該匿名人士說，根據交火規則，海上執法人員不得隨意對空鳴槍，若證實“廣大興28號”漁船船身的50多個彈孔是菲海警開槍所致，相關人員則涉嫌“過度使用武力”，而海警人員在開槍后駛離、未登船檢視受害者，則屬失職，可能面臨刑事及行政訴訟。報道稱，菲方的最終報告要等完成在臺灣的調查才能公布。

　　對此，菲律賓海警發言人巴里羅26日通過《菲律賓星報》稱，“相關媒體報道仍是臆測，我們應等國家調查局最終報告出爐，我們必須了解國家調查局援引哪些環節為依據”，“如果國家調查局說我們的行為失職，它必須解釋原因。我們尊重調查局的發現，將在合適的時間和場合作出回應”。

　　據“中央社”26日報道，均由8人組成的臺灣調查團和菲律賓調查小組27日將分別前往對方地，展開平行調查。菲調查團將檢視“廣大興28號”漁船、走訪目擊者，若取得家屬同意，還將勘驗遭射殺身亡的臺灣漁民洪石成的尸體，檢視死者解剖報告與全案相關錄像。臺灣調查小組除登船、驗槍外，可檢視事發錄像數據、協助訊問涉案人員、檢視筆錄、航程紀錄等。

　　《菲律賓每日問詢者報》25日稱，菲政府對該案的態度一再改變，阿基諾政府最早以“一中原則”為由拒絕同臺灣聯合調查，之后又同意；臺灣調查團觀看案發錄像片段的要求最先也被拒絕，后來菲司法部長德利馬表示，錄像帶內容相當具“揭示性”，最終批準臺灣調查人員觀看。